Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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