Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tuba8Q9JJZ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms