Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad9Q9JIW5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms