Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lmbr1Q9JIT0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms