Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms