Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmod3Q9JHJ0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmod3Q9JHJ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms