Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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