Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp29Q9ES63 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp29Q9ES63 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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