Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trhr2Q9ERT2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms