Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms