Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms