Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tlr1Q9EPQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tlr1Q9EPQ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms