Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trmt112Q9DCG9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trmt112Q9DCG9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms