Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrotQ9DC50 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms