Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms