Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tm9sf1Q9DBU0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms