Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrn2Q9DBR1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrn2Q9DBR1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms