Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrpraQ9DBG7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms