Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fundc1Q9DB70 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms