Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift43Q9DA69 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms