Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms