Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms