Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Calr3Q9D9Q6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Calr3Q9D9Q6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Calr3Q9D9Q6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calr3Q9D9Q6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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