Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd9Q9D9M4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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