Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldnd2Q9D9H2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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