Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oma1Q9D8H7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oma1Q9D8H7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms