Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms