Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifi35Q9D8C4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms