Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms