Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2c55Q9D816 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms