Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn22Q9D7U6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn22Q9D7U6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms