Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms