Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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