Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc81Q9D5W4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc81Q9D5W4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms