Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms