Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pabpc6Q9D4E6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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