Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D454 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D454 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D454 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms