Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmed11Q9D2R4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed11Q9D2R4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms