Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms