Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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