Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms