Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms