Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm1Q9D103 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms