Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx56Q9D0R4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms