Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx17Q9D0I4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx17Q9D0I4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx17Q9D0I4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx17Q9D0I4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms