Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3eQ9CZT4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3eQ9CZT4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms