Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms