Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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