Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PmpcbQ9CXT8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmpcbQ9CXT8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms