Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Xrcc3Q9CXE6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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